Методы обнаружения болезнетворных микроорганизмов, передающихся через воду, часто фокусируются на одном болезнетворном организме или родственной группе организмов (например, Cryptosporidium parvum или колиформах) при исключении других потенциальных патогенов в воде. Таким образом, наблюдается распространение методов обнаружения каждой отдельной патогенной угрозы, которая может присутствовать в водоразделе. Зачастую каждый из этих методов требует значительных манипуляций с пробами, высокого уровня технических знаний и отнимает много времени. Чтобы преодолеть эти проблемы, несколько исследователей исследовали интегрированные системы сбора проб, концентрации проб и очистки. Однако не существует опубликованного метода, использующего интегрированную систему обнаружения. Это означает, что оставшийся обработанный образец по-прежнему требует проведения нескольких анализов для обнаружения всех представляющих интерес патогенов. Микрочипы нуклеиновых кислот, или чипы ДНК, представляют собой последнее достижение в области молекулярных технологий, предоставляя беспрецедентные возможности для мультиплексного обнаружения нуклеиновых кислот. Благодаря возможности размещать тысячи генов на одном предметном стекле и новым чувствительным методам маркировки ДНК или РНК сообщества напрямую, без использования ПЦР, микрочипы могут обеспечить мультиплексное обнаружение всех патогенов, индикаторов и даже их генотипов в образец воды. В этой статье представлены 4 исследования, которые иллюстрируют потенциальное использование микрочипов ДНК для обнаружения и последующего генотипирования патогенов, передающихся через воду. Для первого исследования был протестирован массив генотипирования патогенной кишечной палочки. Массивы четко различали различные генотипы E. coli O157:H7, E.coli O91:H2 и непатогенные E.coli. Во втором исследовании массив однонуклеотидных полиморфизмов был построен на основе последовательности hsp70 Cryptosporidium parvum. Были достигнуты как различия между генотипами, так и обнаружение SNP. ......