Анализ стандартной технической структуры
| Основные элементы | Требования SN/T 5334.2 | Сравнение с обычной ПЦР |
| Технология детекции | Цифровая капельная ПЦР | Количественная флуоресцентная ПЦР в реальном времени |
| Объекты детекции | FG72 и другие 13 генетически модифицированных штаммов | Обычно детекция одного штамма |
| Предел количественного определения | 1,0–3,0 копий/мкл | 10–100 копий/мкл |
Ключевые технологические инновации
В стандарте принята стратегия двойной маркировки зондов (FAM/BHQ1 и TAMRA), которая решается с помощью дизайна трансграничной последовательности:
- 3'-концевое специфическое обнаружение штамма DAS68416-4
- 5'-концевое зацепление штамма MON87708
Параметры циклирования задаются по-разному в зависимости от содержания ГХ. Например, для штамма
CV127 требуется время денатурации 30 с.
Руководство по внедрению и применению
Типичный процесс обнаружения
- Подготовка образца: Измельчение семян сои до размера частиц ≤0,5 мм
- Выделение ДНК: Метод CTAB, требования к чистоте: A260/280=1,8-2,0
- Реакционная система: 60 нг ДНК-матрицы + 2×ddPCR Super Mix
- Программа термоциклирования: Денатурация при 94 ℃ в течение 15-30 с, отжиг при 60 ℃ в течение 44-49 циклов
Ключевые точки контроля качества
- Отрицательный контроль: ДНК сои без ГМО
- Положительный контроль: Стандартные вещества различных штаммов (ERM-AD413 и т. д.)
- Бланк-контроль: Сверхчистая вода вместо матрицы
Предыстория эволюции стандарта
С началом коммерческого выращивания в Бразилии в 2019 году новых сортов сои, устойчивых к насекомым, таких как DAS-81419-2, традиционные методы ПЦР в реальном времени продемонстрировали ограничения в:
- Обнаружении нескольких целей
- Количественной оценке образца низкого уровня
- Устойчивости к помехам от сложных матриц
, что побудило к разработке данного стандарта.