В процессе формулирования этого стандарта, по мере углубления исследований, проект стандарта для обсуждения, проект стандарта и проект стандарта для консультаций были последовательно завершены, а содержание стандарта постоянно улучшалось и имеет тенденцию быть научным и разумным. В соответствии с потребностями основное техническое содержание этого стандарта определяется следующим образом: В терминах и определениях метаданные, микробиом, метагеномика, ампликон, формат матрицы биологических наблюдений, производство данных, анализ данных, данные уровня анализа, хранение данных. определены сервис данных, численность генов, таксономическая численность, функциональная численность, относительная численность, рабочие таксоны, формат FASTQ, формат TSV и т. д. В процессе совместного использования и обмена данными о микробиомах описывается производство, передача и использование данных о микробиоме. Разделите этот процесс на четыре звена: производство данных, анализ данных, хранение данных и услуги по работе с данными, и опишите детали и ключевые моменты каждого звена. В метаданных данных микробиома стандарт делит метаданные на три части в соответствии со связями формирования данных: метаданные, связанные с информацией об образце, метаданные, связанные с данными секвенирования, и метаданные, связанные с данными уровня анализа, стандартизируя каждую часть. Общие метаданные и минимальные элементы обмена данными о микробиоме. Что касается формата данных микробиома, стандарт стандартизирует формат данных микробиома в каждом звене процесса и вводит широко используемые форматы в качестве ссылки. В зависимости от стадии генерации данные микробиома делятся на необработанные данные и данные аналитического уровня. Исходными данными метода высокопроизводительного секвенирования является FASTQ, а данные уровня анализа относятся к информации о составе микробной композиции, полученной в результате анализа исходных данных методами биоинформатики, и предлагается, чтобы TSV (таблично-сегментированный text) и BIOM могут храниться как файлы данных уровня анализа. Используемый формат файла. Кроме того, также предлагаются предлагаемые структуры данных в сценариях сетевого взаимодействия.
T/LTIA 13-2021 История
2021T/LTIA 13-2021 Спецификация совместимости данных микробиома в службах генетического тестирования