Присутствие паразитических простейших в исходной воде, используемой для питья и сельского хозяйства, вызывает растущую обеспокоенность. Несмотря на то, что существует множество протоколов для идентификации этих организмов в клинических образцах (кала, кровь и ткани), эти методы нелегко и не всегда успешно применить к пробам воды из окружающей среды. Авторы сосредоточились на разработке молекулярного метода идентификации Cyclospora cayetanensis в экологических водах. В результате этой работы были выявлены две важные проблемы, которые, вероятно, будут продолжать вызывать беспокойство у водных микробиологов. Одним из хорошо известных является наличие ингибирующих веществ, таких как гуминовые кислоты. Другим, менее изученным, является присутствие в природных водах нечеловеческих патогенных микроорганизмов, хотя и генетически близких. Учитывая, что существуют патогенные и непатогенные виды Cryptosporidium и Cyclospora, двух из трех последних появившихся в воде простейших патогенов, более чем вероятно, что эта трудность в различении патогенных и непатогенных видов повторится в будущем. Включает 22 ссылки, таблицы, рисунки.