GA/T 1693-2020 (Англоязычная версия) Спецификация проверки секвенирования ДНК следующего поколения в судебной медицине - Стандарты и спецификации PDF

GA/T 1693-2020
Спецификация проверки секвенирования ДНК следующего поколения в судебной медицине (Англоязычная версия)

Стандартный №
GA/T 1693-2020
язык
Китайский, Доступно на английском
Дата публикации
2020
Разместил
Professional Standard - Public Safety Standards
Последняя версия
GA/T 1693-2020
 

сфера применения

Анализ основного содержания стандарта

Технические элементы Традиционное секвенирование по Сэнгеру Секвенирование нового поколения (NGS)
Пропускная способность обнаружения Один образец/реакция ≥100 Мб/запуск
Тип маркера Только полиморфизм длины Полиморфизм последовательности (включая вариации последовательности STR)
Размер данных Высота пика электрофореза Глубина секвенирования, значение ACR, Q30 и т. д.

Ключевые технические требования

1. Конфигурация лаборатории

Должна соответствовать требованиям GB/T 27025-2019, строго различая:

  • Область до ПЦР (подготовка образцов)
  • Область после ПЦР (создание библиотеки/секвенирование)

2. Показатели эффективности прибора

Секвенатор второго поколения должен соответствовать следующим требованиям:

  • Качество распознавания оснований: значение Q > 20
  • Точность после фильтрации ≥ 99,9%
  • Длина прочтения обнаружения STR должна охватывать весь ампликон

Инновационные технические положения

Анализ полиморфизма последовательности STR

STR впервые был явно использован в качестве маркера полиморфизма последовательности:

  1. GRCh38 использовался в качестве референсной последовательности
  2. Последовательности одинаковой длины, но разные, считаются независимыми аллелями
  3. Частота популяции должна быть основана на статистике полиморфизма последовательности

Контроль качества система

Индикаторы Требования
Глубина секвенирования STR≥установленного порога; SNP/InDel≥100×
Значение ACR Гетерозиготные локусы должны быть ≥0,6

Рекомендации по внедрению

Ключевые моменты для лабораторной валидации

  • ПроведитеУстановите локализованную пороговую систему (например, минимальную глубину секвенирования).
  • Регулярно проводите внешнюю оценку качества.

Вопросы анализа данных.

Особое внимание следует уделять:

  1. Совместимости наименований последовательностей STR и полиморфизмов длины.
  2. Митохондриальная ДНК должна быть выровнена с референсной последовательностью rCRS.
  3. Совместный анализ сцепленных генетических маркеров.

GA/T 1693-2020 Ссылочный документ

  • GA/T 383-2014 Технические условия на экспертизу ДНК-лаборатории судебно-медицинской экспертизы
  • GB/T 27025-2019 Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий

GA/T 1693-2020 История

  • 2020 GA/T 1693-2020 Спецификация проверки секвенирования ДНК следующего поколения в судебной медицине
  • 2019 GA/T 1693-2019 Судебно-медицинская проверка пломб. Часть 4: Сравнение измерений
Спецификация проверки секвенирования ДНК следующего поколения в судебной медицине

Специальные темы по стандартам и нормам

стандарты и спецификации




© 2025. Все права защищены.