GB/T 40226-2021 (Англоязычная версия) Обнаружение микробного метагенома окружающей среды — высокопроизводительное секвенирование - Стандарты и спецификации PDF

GB/T 40226-2021
Обнаружение микробного метагенома окружающей среды — высокопроизводительное секвенирование (Англоязычная версия)

Стандартный №
GB/T 40226-2021
язык
Китайский, Доступно на английском
Дата публикации
2021
Разместил
General Administration of Quality Supervision, Inspection and Quarantine of the People‘s Republic of China
Последняя версия
GB/T 40226-2021
 

сфера применения

Анализ стандартной технической структуры

Основные элементы Технические требования Инновационные точки
Сбор образцов Независимые спецификации для трех типов образцов окружающей среды (фекалии/почва/вода) Впервые создана схема хранения стабилизатора комнатной температуры
Контроль качества ДНК Q20≥90%, Q30≥80% Внедрение системы оценки карты целостности
Данные Объем ≥1×107 допустимых последовательностей Четко определить минимальный порог обнаружения

Подробное объяснение ключевых технических показателей

Требования к приборам и оборудованию

Стандарт предусматривает использование основного оборудования, такого как высокопроизводительные секвенаторы и охлаждаемые центрифуги (≥12 000 g), включая:

  • Этап выделения ДНК: для определения концентрации требуется УФ-спектрофотометр
  • Этап создания библиотеки: точность контроля температуры прибора ПЦР должна быть ±0,5°C
  • Условия хранения: низкотемпературный холодильник -80°C должен иметь функцию сигнализации температуры

Предложения по реализации

План конструкции лаборатории

  1. Управление зонами: строго разграничьте зону подготовки реагентов, зону обработки образцов и зону амплификации
  2. Контроль воздушного потока: используйте однонаправленный поток воздуха, чтобы избежать перекрестного загрязнения
  3. Узлы контроля качества: настройте трехступенчатый контроль качества для выделения ДНК, создания библиотеки и вывода данных

Стратегия применения базы данных

Рекомендуется сначала использовать внутренние базы данных, такие как CNCB/NGDC, а также международные базы данных в качестве дополнительной проверки. При создании аннотаций необходимо указать следующее:

  • Версия базы данных и время обновления
  • Настройка порога сходства (≥95%)
  • Требование покрытия (≥90%)

Стандартный эволюционный анализ

Этот стандарт имеет три основных прорыва по сравнению с традиционным методом культивирования:

Измерение сравнения Традиционный метод Этот стандартный метод
Процент обнаружения <1% культивируемых микроорганизмов >90% видов сообщества
Период 2-4 недель 3–5 рабочих дней
Размеры данных Информация об одной колонии Виды + Функциональные гены + Метаболическая сеть

GB/T 40226-2021 Ссылочный документ

  • GB 19489  Лаборатории. Общие требования биобезопасности.
  • GB/T 35537-2017 Требования к оценке результатов высокопроизводительного секвенирования генов
  • GB/T 6682  Вода для аналитических лабораторий. Спецификация и методы испытаний.

GB/T 40226-2021 История

  • 2021 GB/T 40226-2021 Обнаружение микробного метагенома окружающей среды — высокопроизводительное секвенирование
Обнаружение микробного метагенома окружающей среды — высокопроизводительное секвенирование

Специальные темы по стандартам и нормам

стандарты и спецификации

DANSK DS/ISO/TS 24420:2023 Биотехнология. Массивно-параллельное секвенирование ДНК. Общие требования к обработке данных метагеномных последовательностей дробовика PD ISO/TS 24420:2023 Биотехнология Массивно-параллельное секвенирование ДНК Общие требования к обработке данных дробовых метагеномных последовательностей ISO/TS 24420:2023 Биотехнология. Массивно-параллельное секвенирование ДНК. Общие требования к обработке данных дробовых метагеномных последовательностей NACE Paper 13504-2019 Биопленки в промышленных водных системах: метагеномный анализ популяций биопленок с помощью новой системы биомониторинга в реальном времени DANSK DS/ISO/TS 22690:2021 Геномная информатика - критерии оценки надежности высокопроизводительных данных об экспрессии генов ISO/TS 22690:2021 Геномная информатика. Критерии оценки надежности высокопроизводительных данных об экспрессии генов ISO 11063:2020 Качество почвы. Прямое извлечение почвенной ДНК UNE-EN ISO 11063:2020 Качество почвы — прямое извлечение ДНК почвы (ISO 11063:2020) (одобрено Испанской ассоциацией нормализации в ноябре 2020 г DIN EN ISO 11063:2019 Качество почвы. Метод прямого извлечения ДНК из образцов почвы (ISO/DIS 11063:2019); Немецкая и английская версия prEN ISO 11063:2019 SS-EN ISO 11063:2020 Качество почвы - Прямой извлечение ДНК почвенных организмов (ISO 11063:2020



© 2025. Все права защищены.