Молекулярные методы, нацеленные на нуклеиновые кислоты, позволяют нам охарактеризовать бактериальные популяции без процедур культивирования. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) стала методом выбора для анализа популяции бактерий в пробах воды. В этом исследовании для бактериологического анализа воды использовались два молекулярных подхода, основанных на ПЦР-амплификации нуклеиновых кислот, экстрагированных из концентратов фильтрованной воды: подход широкого спектра, состоящий из анализа рРНК на основе ПЦР для определения микробного разнообразия в пробе подземных вод, и метод широкого спектра. специфический ПЦР-анализ для непосредственного обнаружения целевого микроорганизма в пробах воды. Материалы и методы для стратегии, основанной на молекулярной рРНК, включают: сбор проб воды; бактериологическое исследование; экстракция и очистка геномной ДНК; создание библиотеки клонов бактериальных малых субъединиц рДНК; ПДРФ-анализ; и анализ последовательности и регистрационные номера нуклеотидов. Материалы и методы для специфического ПЦР-анализа включают: обработку проб воды; амплификация с помощью вложенной ПЦР; и дот-блот-гибридизация. Обсуждаются результаты и выводы.